связаны как с характером, так и с темпераментом. Еще 24 набора SNP были напрямую связаны с характером и косвенно с темпераментом. Еще 28 наборов SNP были напрямую связаны с темпераментом и косвенно с характером.
Какие новые типы темперамента открыты по результатам генетических исследований?
В трех крупных независимых исследованиях общегеномных ассоциаций, проведенных в Финляндии, Германии и Корее, было выделено три типа темперамента:
• эмоциональный (поступки обусловлены привычками и эмоциями);
• организованный (высокий уровень самоконтроля за эмоциями и поведением);
• творческий (креативный).
В этом же исследовании было выделено еще 3 типа темперамента:
1. с «легким» темпераментом – люди-экстраверты, которые хорошо контролируют свою деятельность, спокойные эмоционально и настойчивые;
2. с «трудным» темпераментом – люди невротичные и нестабильные, пессимистичные, боязливые, застенчивые;
3. с «медленно разогревающимся» темпераментом – такие люди социально отстранены, беспечны и импульсивны.
Данные типы темперамента были выделены на основании анализа 972 генов.
Каким образом гены могут влиять на темперамент?
Гены, отвечающие за темперамент, также участвуют в регуляции работы нервной системы, отвечают за энергетические процессы в головном мозге, тем самым регулируя и поведение человека. Как правило, несколько групп генов отвечают за одну особенность темперамента и черту характера. Гены, кодирующие изменчивость человеческого темперамента, также определяют реакцию человека на стресс. Гены личности обнаружены в большинстве систем органов, а не только в мозге, поэтому физические, психические и социальные аспекты здоровья тесно взаимосвязаны.
А может ли характер/темперамент влиять на здоровье? Что говорит наука?
В исследовании общегеномных ассоциаций было показано, что показатели уровня здоровья у людей с креативным типом темперамента были выше, чем у людей с организованным и эмоциональным профилями темперамента.
Глава 7
ДНК-тесты
Все ли ДНК-тесты одинаковы?
За последнее десятилетие благодаря развитию технологий исследования ДНК, накоплению колоссальных научных данных ДНК тесты стали весьма популярны и вышли за пределы медицинского сообщества. Научные исследования приоткрывают работу механизмов развития многих признаков у человека: от склонности к заболеваниям до особенностей усвоения некоторых компонентов пищи и даже формирования внешних данных. Научные отделы компаний, занимающихся генетическим тестированием, могут понятным языком дать такую информацию каждому желающему. Таких компаний достаточно много, однако чаще всего они используют лишь несколько технологий, о которых мы и поговорим в этой главе.
Полимеразная цепная реакция (ПЦР)
Некоторые компании предлагают тестирование ограниченного (зачастую очень небольшого) набора генетических признаков путем проведения нескольких ПЦР, проверяющих наличие того или иного конкретного генетического варианта. Одна ПЦР проверяет только одну генетическую вариацию, допустим, может проверить один вариант, отвечающий за непереносимость молочного сахара – лактозы.
Плюсы этой технологии в том, что анализ можно сделать в короткие сроки, а реагенты можно даже зарегистрировать как медицинское изделие. Регистрация подразумевает множество этапов валидации данных и лабораторного процесса, и если компания успешно регистрирует свой продукт как медизделие, то часто это говорит о его высокой точности. Также такая регистрация позволяет выдавать медицинские заключения.
Из минусов технологии стоит отметить относительную дороговизну анализа каждой отдельной точки в геноме и, как следствие, ограниченность количества возможных вариаций для тестирования. Таким способом исследовать десятки и тем более сотни генетических вариантов становится невыгодно, так как стоимость такого сложного продукта будет очень высокой. Классическими примерами применения ПЦР для генетических исследований являются анализы на некоторые генетические заболевания, APOE, фармакогенетику в сетевых клинико-диагностических лабораториях.
Секвенирование NGS
Секвенирование ДНК позволяет выявить почти полную последовательность всего генома и выявить наличие практически всех генетических изменений. Получив с секвенатора огромный массив генетических данных, дальше их сравнивают с условным образцом ДНК, и это дает не менее внушительный объем информации о каждом человеке.
Секвенирование применяется в трех главных видах анализа:
1. полногеномное секвенирование, в котором исследуется весь геном (около 100 % генетической информации), в том числе митохондриальная ДНК (небольшая кольцевая ДНК с примерно 40 генами, которую мы наследуем от матери);
2. полноэкзомное секвенирование, в котором исследуется весь экзом – кодирующая белки часть ДНК (это 1–2 % всей ДНК с информацией только о кодирующих участках генов – экзонах, без «генетических пробелов» – интронов);
3. генные панели, в которых исследуется заранее предопределенный для панели ограниченный набор десятков-сотен генов. Часто это нужно для поиска генетической причины различных заболеваний, например эпилепсии или болезней сердца.
Секвенирование позволяет устанавливать не только, какие «буквы» находятся в том или ином участке генома, но и находить большие структурные изменения ДНК (протяженные участки отсутствия или удвоения генетического материала, которые сложно выявить другими скрининговыми методами). Помимо этого мы можем узнать, какие варианты генов пришли от одного родителя и как эти варианты расположены на одинаковых парных хромосомах. Этот процесс называется фазированием и иногда нужен для установления или подтверждения клинического диагноза.
Секвенирование также позволяет устанавливать с высокой точностью целые последовательности «букв» – нуклеотидов, расположенные рядом на одной хромосоме внутри одного гена. Этот подход активно используется в фармакогенетике для подбора эффективных препаратов и типировании HLA аллелей. Стоимость таких исследований активно снижается с 2008 года, а ценность только увеличивается из-за развития науки и появления данных, которые дают возможность использовать результаты секвенирования на протяжении всей дальнейшей жизни и находить что-то новое.
Множество компаний сейчас предлагают услуги секвенирования генома или экзома с предоставлением клиенту данных в разных форматов, в том числе файлы с прочтениями (так называемые «сырые данные») и файлы с генотипами для всех проанализированных генетических вариантов.
Генотипирование на чипах
Генотипирование на ДНК микрочипах является самым распространенным и относительно недорогим методом генетического анализа. Чипы позволяют одновременно анализировать сотни тысяч заранее предопределенных участков генома. Чип так устроен, что каждая ячейка в нем проверяет наличие или отсутствие только двух вариантов в одной точке генома. Но можно проверить и большее количество вариантов, если использовать данные с других ячеек и специальным образом эти данные обработать. Технология генотипирования на чипах не регулируется в РФ, однако в некоторых странах она (или ее часть – например, некоторые отдельные анализируемые участки ДНК) зарегистрирована как медицинское изделие, что приравнивает ее медицинскую ценность к ПЦР анализам. По результатам такого теста мы получаем информацию о том, какие «буквы» человек получил от своих родителей в той или иной точке генома.
Если же говорить о ДНК тестах не с точки зрения технологии, а интерпретации генетических данных, то все зависит от компании и ее политики. Компании сами выбирают исследования, которые хотят использовать для интерпретации данных пользователя и выдачи ему каких-либо результатов.
Стоит отметить, что разные исследования имеют разную доказательность и статистическую ценность, поэтому не всегда огромное количество признаков в интерпретации той или иной компании говорит о том, что это хороший тест. Напротив, это
