Сам Статут несколько лет создавала специальная комиссия, в которую входили представители разных конфессий и слоев населения. Статьи и разделы Статута обсуждались на поветовых собраниях – сеймиках. Лев Сапега писал: «Правовое устройство есть цель и конец всех прав на свете, им все государства стоят и в целости сохранены бывают». Статут утвердил, что власть должна подчиняться закону и единому для всех суду. Лев Сапега ввел ответственность шляхты за убийство крестьянина – этого в прежних законах не было. Вводился институт адвокатов, судьи были обязаны оправдывать людей, чья вина не была доказана. За преступление против женщины устанавливалась двойная ответственность. Под охрану государства попала и природа, вводился порядок пользования землей, водой, лесами. Статут подтверждал право Княжества чеканить свои деньги, оно могло не участвовать в боевых действиях и войнах, которые вела Польша. Первенство права, которому подчинялся король и великий князь, считалось «сокровищем в руках наших, которое ни за какие деньги нельзя купить». Статут 1588 года действовал в Великом княжестве Литовском двести пятьдесят лет.
В 1589 году Лев Сапега стал канцлером Великого княжества Литовского, главным представителем власти в Княжестве.
Теперь он полностью отвечал за внутреннюю и внешнюю политику, принимал и отправлял посольства, проводил сеймы всех уровней, отвечал за деятельность местных властей, правоохранительной системы, регулировал различные конфликты между ветвями власти. Ему подчинялись подканцлер, великий гетман, воеводы, каштеляны, подскарбии, маршалки, Трибунал и даже Всеобщий сейм. Канцлеру не подчинялась только экономическая жизнь Княжества, только король и великий князь раздавал земли, подписывал привилеи и грамоты для шляхты. Король назначал и духовных лиц. В 1590 году Сигизмунд III пытался назначить на освободившуюся вакансию виленского епископа поляка, но Лев Сапега вынес протест – согласно Статуту. Конфликт короля Речи Посполитой и великого канцлера продолжался десять лет, но виленским епископом стал выходец из Великого княжества Литовского. Лев Сапега писал, что «покой Отчизны своей до конца жизни сохранять буду».
Король был вынужден согласовывать все документы Великого княжества Литовского с его канцлером. Без визы и печати Льва Сапеги документы короля не имели юридической силы на территории Княжества. Великий канцлер постоянно находился в Вильне, периодически выезжал в Краков к королю. Работы у великого канцлера всегда было очень много. Он разбирал шляхетские конфликты, вел многочисленные дипломатические переговоры, занимался проблемами охраны границ, усовершенствовал и упорядочил архив Великого княжества Литовского. Великий канцлер всегда подчеркивал, что закон важнее силы.
По приказу великого канцлера в течение 1594–1607 годов были переписаны все книги Метрики Великого княжества Литовского, чтобы при их частом использовании они не пришли в негодность – именно благодаря этому уникальные документы дошли до наших дней. 556 томов Метрики, архива XIV–XVII веков, содержат записанные в хронологическом порядке все важнейшие исторические события в Великом княжестве Литовском.
В 1596 году на церковном соборе в Бресте Лев Сапега в звании королевского комиссара выступил в защиту унии между православием и католичеством. Национальную общую церковь в Великом княжестве Литовском, однако, создать не удалось, в княжестве активно действовали три конфессии. Сам Сапега строил католические, православные, униатские храмы, основывал при них школы, его типографии издавали много книг. Он объявлял: «Каждого, кто ссорит христиан, я сейчас вызываю на суд Божий страшный, и с ним о том на страшном суде Христовом судиться буду, и на суде ему это пусть не будет прощено».
В 1599 году, через пять лет после смерти первой жены, Лев Сапега женился на княжне Елизавете Радзивилл, дочери великого гетмана литовского.
После смерти московского царя Федора Ивановича в 1598 году Лев Сапега предложил московским боярам кандидатом в цари Сигизмунда III, но царем стал Борис Годунов. Сигизмунд захотел получить и корону Швеции – своей родины. Великое княжество Литовское ждала новая война. Чтобы не воевать на два фронта, необходимо было договориться с Москвой.
В начале октября 1600 года во главе посольства из тысячи человек Лев Сапега отправился в Москву. Он вез с собой предложения по созданию унии трех славянских государств. В Европе действовала Католическая лига, фактически уже был создан протестантский союз, во главе мусульманского мира стояла султанская Турция. Уже началась в Балтии война Швеции и Речи Посполитой, военные действия вот-вот могли начаться и на землях Великого княжества Литовского. Лев Сапега вполне продумал объединение трех славянских государств. Он предложил Москве:
Государи и дворяне союзных государств должны быть «в союзе и вечной нераздельной братской любви». Союзники не заключают договоров, вредным братским государствам, их внешняя политика должна быть согласована, в случае военной угрозы государства помогают друг другу.
Завоеванные сообща земли должны принадлежать тому государству, которое «имеет на них права». Если ранее новые земли были чужие, то их надо было поделить или владеть ими сообща.
Шляхта и дворяне могли служить в обеих странах, жениться между собой без препон, получать земли там, где их выслужат. Государства могли свободно обмениваться студентами, предлагалась свобода вероисповедания, можно было бы строить в Речи Посполитой православные храмы, в Московском государстве – костелы. Купцы могли свободно торговать в новом союзе, преступники подлежали экстрадиции. Были необходимы две короны – при коронации одна возлагается московским послом на голову государя Речи Посполитой, другая возлагается польско-литовско-белорусским послом на голову московского царя.
Государь Речи Посполитой выбирается с учетом мнения московского царя. Если у Сигизмунда III не будет наследников, Речь Посполитая может выбрать государем царя. После московского царя его сын при вступлении на престол клятвой и присягой подтверждал союз-унию. Если у московского государя не будет наследников, московский трон занимает Сигизмунд.
Предложения Льва Сапеги московским боярам были реальными, их можно было обсуждать, по ним можно было договориться. В середине октября 1600 года великое посольство прибыло в Москву.
Через полтора месяца Льва Сапегу в Боярской думе принял царь Борис Годунов. Великий канцлер Литовский выступил перед московским царем и боярами:
«Мы славяне – единый народ, Бога прославляем единого. Одного этого достаточно, чтобы заключить вечный мир между государствами, установить дружбу между государями, чтобы между собой вечную любовь и согласие имели и против всех поганых выступали».
Переговоры о союзе шли всю зиму и были очень усложнены приездом в Москву в феврале 1601 года шведского посольства. Заключить унию Речи Посполитой и Московского царства не удалось, но двадцатилетнее перемирие было подписано и в начале 1602 года ратифицировано. Лев Сапега писал о московских боярах: «Ничего серьезного с нами заключать не хотели, только требовали князю своему царского титула и возврата земли Инфлянтской». В апреле 1601 года Лев Сапега вернулся домой.
Польша вела войну за шведскую корону. Войска поляков проходили в Балтию по землям Великого княжества Литовского, которые разорялись почти как во время ведения боевых действий. Увещевания польским войскам не помогали, Льву Сапеге пришлось приводить хоругви Княжества в боевую готовность и в январе 1603 года на Всеобщем Сейме в Слониме ультимативно потребовать от Польской Короны наказания преступников, грабивших население, а также материальной компенсации для ограбленных жителей.
Великий канцлер Литовский Лев Сапега не поддержал Лжедмитрия в его походе на Москву. На сейме 1605 гола он осудил попытки переворота авантюриста и претендента на царский трон. Сторонник унии Речи Посполитой и Московского царства и не мог поступить иначе. Лев Иванович заявил, что король и великий князь не отвечает за действия самозванца, а Речь Посполитая сохраняет перемирие с Москвой. Перемирие, впрочем, продолжалось не двадцать лет.
После убийства в Москве в мае 1606 года Лжедмитрия I Лев Сапега пришел к выводу, что войны с Москвой не избежать. На сейме 1609 года канцлер решительно высказался за вступление Речи Посполитой в войну с царством, «потому что никогда Речь Посполитая лучшей оказии для расширения границ не имела».
Весной 1609 года войска короля Сигизмунда III и Лев Сапега с тысячей воинов собственной хоругви пошли на Смоленск. Несмотря на то, что в Московском царстве было двоевластие, в Кремле сидел Василий Шуйский, а в Тушино – Лжедмитрий II, с ходу Смоленск взять не удалось, город держался полтора года.
