В России же попытка создать современную структуру управления после хаоса Смуты в сочетании с истощением, вызванным Польской, Украинской и Шведской кампаниями, привели к перенапряжению сил новой монархии. Неудачи на Украине совпали в Великороссии с социальными и религиозными смутами. Снова, как и в 1648 г., в 1661–1662 гг. начались беспорядки; в 1662 г. в Коломенское, где пребывал в то время царь, явилась разгневанная толпа, которая потребовала расправиться с некоторыми чиновниками, и «он спасся лишь благодаря решительным действиям своей охраны; пострадало 7 тысяч человек».
Летом 1660 г., заключив со шведами Оливский мир, поляки возобновили войну с Россией; в Литву и Белоруссию вторглись войска Сапеги и Чарнецкого, ветерана битвы при Берестечко, и разгромили у Полонки князя Хованского. Сразу же стало понятно, какую огромную роль сыграли украинские казаки во время предыдущей российско-польской войны. Когда Хмельницкий воевал на стороне русских, им удалось сокрушить поляков под Смоленском, Львовом и Люблином. Теперь же, когда казаки разделились, русская военная мощь не могла противостоять польской.
На Украине к старому коронному гетману Стефану Потоцкому, чей разгром 12 лет назад под Желтыми Водами вызвал Потоп, присоединились 20 тысяч крымских татар. Совместными силами они двинулись на московского воеводу Шереметьева, стоявшего на границах Волыни. Вновь избранный гетман Юрий Хмельницкий бросился на помощь Шереметеву. Однако слухи о разгроме русских на севере воодушевили сторонников Выговского: Петр Дорошенко вступил в переговоры с поляками, а Юрий Хмельницкий не только признал Гадячское соглашение, но и присоединился к Потоцкому. Шереметьев, окруженный поляками, татарами и казаками, переметнувшимися на сторону поляков, решил капитулировать, выдвинув условие, что ему разрешат свободно уйти в Россию со всем своим войском. Но не успел он сдаться, как татары принялись резать беззащитных русских солдат, а сам Шереметьев и его воеводы князь Щербатов и Козловский были уведены в Крым, где эти несчастные бояре провели в неволе 20 лет своей жизни!
Предательство Юрия Хмельницкого не спасло жителей Правобережной Украины, ибо Потоцкий, игнорируя Гадячское соглашение, послал туда свою конницу, велев им жестоко покарать крестьян за все зверства, которые они в течение 12 лет чинили над польской шляхтой.
В Левобережной Украине казаки Черниговского, Нежинского и Переяславского полков решили сбросить Юрия Хмельницкого и избрали временным гетманом переяславского полковника Самко. Царь Алексей вознаградил Самко за его верность, но из-за хаоса, царившего на Украине весь 1662 г., московское правительство не торопилось признавать гетманом никого.
Гражданская война вспыхивала то на левой, то на правой стороне Днепра. Самко был не единственным, кто хотел стать гетманом, этот пост хотели занять многие: нежинский полковник Василий Золотаренко (родственник героя последней войны с Польшей, погибшего в 1665 г.), Петр Дорошенко, Павло Тетеря и Иван Брюховецкий, когда-то верный слуга Хмельницких, а теперь ставший любимцем запорожских казаков. Юрий Хмельницкий с каждый днем терял свои позиции и много раз бывал разгромлен в стычках с войсками Самко и Ромодановского. В конце концов он отказался от гетманства и постригся в Мошнинский монастырь. Поляки признали гетманом сподвижника Хмельницкого Павло Тетерю; Самко продолжал оставаться гетманом Правобережной Украины, а Запорожская Сечь избрала Брюховецкого. Москва отказалась признавать всех троих, но два чиновника, князь Гагин и Кирилл Хлопов, посланные разузнать, кто из них сильнее, сообщили, что Брюховецкий принадлежал к числу тех людей, которые умели собирать урожай там, где ничего не было посеяно, и что он «подходит для роли гетмана, поскольку, хотя и не знает грамоты, умен, а что касается воровства — то за ним этого нет. Если назначить его, то мы в Москве можем спать спокойно».
Московские власти решили, что Брюховецкий, честолюбивый, беспринципный и способный человек, поднявшийся из низов, являлся наиболее подходящим кандидатом для царского правительства именно потому, что он был близок к самым низшим слоям украинского населения. Казацкая верхушка, люди, бывшие когда-то ближайшими сподвижниками Хмельницкого, — Выговский, Павло Тетеря и даже сын гетмана Юрий — все оказались изменниками. Они предали не только царя, но и свой собственный народ, который не хотел возвращения поляков и восстановления прежнего классового режима.
Описание Рады, собравшейся в 1663 г. в Нежине для выборов гетмана, дает представление о том хаосе, который царил в ту пору на Украине. Как писал Маркович: «18 июля грохот барабанов собрал людей у посольского шатра, в котором находились князь Гагин, Хлопов и другие. Никогда еще на Украине не было такой Рады. Брюховецкий, стоявший среди запорожцев, переругивался с Самко и Золотаренко. Переяславский полк орал: „Хотим Самко!“; „Золотаренко!“ — кричали нежинцы. Крики запорожцев „Брюховецкий, Брюховецкий“, — заглушили все звуки. Царские послы пытались установить тишину, но шум и недовольство росли, начались потасовки, сверкнули ножи; разные группы в толпе избивали друг друга, и все завершилось кровопролитием. Самко попытался бежать, прячась за шатром московских послов, но чуть было не погиб под ударами запорожцев. В самом шатре и вокруг него многие были забиты насмерть. Князя Гагина беснующаяся толпа чуть было не разорвала на части. Казаки Самко и Золотаренко, увидев, что сопротивляться запорожцам бесполезно, присоединились к ним; Брюховецкого взгромоздили на стол, покрытый штандартом, и провозгласили гетманом».
Однако он не удовлетворился этим и, став гетманом, арестовал Самко, Золотаренко и нескольких других полковников, очевидно опасаясь, что колесо Фортуны может повернуться еще раз. В сентябре того же года арестованные были казнены безо всякого следствия, хотя никто не мог доказать их измены царю. Современник так описывал казнь Самко (палачом был татарин): «Увидев красоту лица и геркулесова тела Самко, палач был поражен. Он долго не решался поднять топор, но его заставили, и голова храбреца скатилась в пыль».
Осенью 1663 г. ситуация на Украине стала более определенной: с одной стороны были польские войска, которых поддерживали знаменитые казацкие полковники Павло Тетеря, Петр Дорошенко, Богун и Гуляницкий, с другой — московиты и чернь: Брюховецкий, любимчик простого народа, и его запорожцы.
Польские успехи в Литве, где у русских был отвоеван город Вильно, и в Белой Руси позволили королю Яну-Казимиру задуматься о возвращении Украины. В Волыни собрали 40 тысяч польских солдат, войско же возглавил сам король. Ему помогали такие прославленные полководцы, как старый Стефан Чарнецкий и Ян Собеский. В королевском лагере появился «воевода Киевский» Выговский. Ян-Казимир переправился через Днепр, и ни казаки Брюховецкого, ни рассеянные московские полки не решались сойтись с ним в открытом поле. Они укрылись в укрепленных городах, которые вскоре сдались казацким полковникам, пришедшим вместе с польской армией. Поляки вместе со своими татарскими подручниками были безжалостны: они разоряли поля и жгли села, а крестьяне в ужасе тысячами бежали в «Новую Украину», на северо-восток. Только Нежин остался верен царю, и, обойдя его, поляки вторглись в северские земли. Однако войско короля застряло у крепости Глухов, которую защищали казаки Черниговского, Нежинского и Стародубского полков. Они оказали полякам упорное сопротивление. Приближалась весна, а с ней и половодье на реках; опустошенная земля не могла прокормить польскую армию, а на помощь Глухову спешил князь Ромодановский. Ян-Казимир внезапно покинул лагерь (политическая ситуация в Варшаве резко ухудшилась), и Чарнецкий стал отходить за Днепр. Его преследовало войско Брюховецкого, а в Правобережной Украине запорожский атаман Сирко, узнав о польском поражении под Глуховом, поднял восстание казаков и крестьян. Сирко взял Умань и Брацлав; Чигирин же и Белую Церковь продолжали удерживать Выговский и Тетеря, оставшиеся верными королю. Вскоре здесь начались беспорядки: Выговского безо всяких оснований обвинили в «измене королю» и поспешно расстреляли.
Чарнецкий оказался под стать казацким полководцам. Этот старый враг украинских казаков нанес несколько сильных ударов войскам гетмана Брюховецкого и атамана Сирко. Он вел беспощадную войну, стирая с лица земли города и села, которые поддерживали «мятежников», приказал также сжечь Субботов, вотчину Хмельницких. Тела Богдана Хмельницкого и его старшего сына Тимоша выбросили из могилы и сожгли, а пепел развеяли по ветру. Начиная с битвы при Кумейках в 1638 г. Чарнецкий провел всю свою жизнь в беспрерывных войнах. Кампания 1664 г. оказалась для него последней — он умер осенью в весьма преклонном возрасте.
В Дуновичах начались переговоры о мире между Польшей и Россией, которые, как думали поляки, завершатся благоприятным для них договором. А тем временем новый великий гетман Любомирский своими действиями готовил в Польше династический кризис, который должен был рано или поздно разразиться, поскольку здоровье Яна-Казимира ухудшалось, а наследника мужского пола у него не было.
