Александрии, и зимой 385–386 года прибыли в Иерусалим. Некоторое время они жили в монастыре у Руфина и Меланьи.
Наконец летом 386 года Иероним со спутницами прибыл в Вифлеем. Павла на свои средства построила два монастыря – женский и мужской; в последнем настоятелем стал Иероним. В Вифлееме Иероним прожил более тридцати лет.
По прибытии в Вифлеем Иероним продолжил работу по исправлению перевода Ветхого Завета. Первоначально Иероним поставил себе задачу перевести на латинский язык текст Септуагинты, который считал боговдохновенным. Позднее Иероним пришёл к выводу, что боговдохновенным нужно считать только текст на еврейском языке и занялся переводом с еврейского оригинала.
Большим подспорьем для Иеронима служили так называемые «Гексаплы» Оригена. За сто лет до Иеронима Ориген проделал громадную работу по подготовке ветхозаветного текста Библии для комментариев. Он представил ветхозаветный текст Библии переписанным в шести параллельных столбцах: первые два столбца – еврейский текст, переданный еврейскими и греческими буквами, далее четыре известные в то время переводы на греческий язык, в том числе LXX. «Гексаплы» Оригена хранились в кесарийской библиотеке. От Вифлеема до Кесарии около девяноста километров, куда и выбирался время от времени Иероним.
Далеко не все христиане одобряли деятельность Иеронима по переводу Ветхого Завета с еврейского языка. Иеронима упрекали в самомнении и неуважении к Септуагинте. Примешивалось недоброжелательное отношение к иноверцам. В IV веке вражда христиан с евреями усилилась. Иероним переключился на еврейский текст Библии в 390 году, а двумя годами ранее, в 388 году, произошла история с поджогом синагоги, когда епископ Милана Амвросий горячо защищал поджигателей.
В посвящении своим друзьям новых переводов отдельных глав Библии Иероним возмущался тем, что его обращение к еврейским первоисточникам возбуждает невежественных людей и предлагал своим друзьям показывать переводы только просвещенным людям, которые смогут оценить его усилия.
Иероним был любопытен и въедлив. На несуразицы и нестыковки текстов Библии Иероним открыто указывал. Если о Мафусаиле написано, что он жил четырнадцать лет после потопа, но, однако не входил в ковчег с Ноем, то что-то тут было не так.
Несколько лет римские священнослужители и монахи игнорировали Иеронима и его труды. Официально общение возобновилось, после того как в Риме разразилась полемика крайних аскетов с неким Иовинианом. Горячий сторонник сурового аскетизма, Иовиниан проповедовал и сам придерживался практики аскетизма. Измождённый от недоедания, он ходил босиком в грязном чёрном одеянии, и всячески избегал общения с женщинами. Внезапно что-то с ним произошло. Он решительно изменил свои взгляды. Иовиниан раскритиковал всю концепцию более совершенной жизни, достигаемой аскетизмом. Иовиниан говорил, что умерщвление плоти не имеет отношения к истинному христианству. Сам он стал вести нормальный образ жизни и утверждал, что если человек искренне принял крещение, то нет никакой разницы, женат ли он, вдовец или воздерживается от женитьбы. Христиане, искренне принявшие крещение, не могут попасть в услужение дьяволу. Если они согрешат, их грех может быть смыт раскаянием. Христиане, умерщвляющие себя постами никак не выше христиан, нормально питающихся и воздающих хвалу Господу. А ещё Иовиниан говорил, что Дева Мария, хотя и зачала Христа в девственном состоянии, потеряла девственность, когда его рожала. К тому же в священных книгах есть указания, что у Христа были братья и сестры.
Римский синод отлучил Иовиниана от церкви. Иовиниан обратился в Милан, ища защиты, но не нашёл никакой поддержки от ярого сторонника девственности епископа Амвросия. В Милане Иовиниана отлучили от церкви во второй раз.
Римское духовенство официально обратились к Иерониму, чтобы тот дал отпор неправедному учению, будоражившему Рим. Иероним прислал из Вифлеема свой трактат «Две книги против Иовиниана». Это – самый длинный из всех его памфлетов, самый гневный, самый невыдержанный и грубый на язык. Больше всего Иеронима возмутило уравнивание замужнего положения с девственностью. Женщина – существо сексуальное. Именно Ева ввергла в грех Адама, пользуясь своей привлекательностью. Только будучи девственницей, женщина может уравняться в духовном развитии с мужчиной.
В запутанной истории развития христианского учения, в какой-то момент церковники подвергли критике толкование Троицы Оригеном и увидели в его трактовке источник ереси. В 393 году Иеронима и Руфина обвинили как последователей Оригена. Руфин отказался сделать формальное отречение от своих взглядов по этому вопросу, а Иероним согласился. Возможно, ему просто хотелось продолжить работу, и он не хотел, чтобы к нему приставали с ненужными спорами.
В 397 году, после двадцати пяти лет пребывания на Востоке, Руфин покинул монастырь в Иерусалиме и вернулся в Италию. Для начала он представил римлянам свой перевод книги Евсевия Кесарийского «В защиту Оригена». В том же году он опубликовал в Риме перевод главного труда Оригена «О началах». В предисловии Руфин написал, что когда-то Иероним восхищался Оригеном. Своим упоминанием старых увлечений Руфин чрезвычайно разозлил Иеронима. Многолетняя великая дружба закончилась великой ссорой. Иероним обладал темпераментом, далёким от христианского смирения. Иероним яростно раскритиковал и Оригена, и Руфина (Иероним всё делал яростно). Тем не менее, Руфин до конца своих дней остался верен «вредоносному учению». В 399 году Руфин покинул Рим.
Последние годы Иеронима были горестными. В 404 году умерла Павла. Её деньги были потрачены ещё до её смерти. Монахи и монахини часто голодали и можно только догадываться о тех трудностях, с которыми им пришлось столкнуться. В 410 году в Вифлеем дошла весть о взятии готами Рима. Среди множества печальных известий пришло сообщение о гибели Марцеллы.
Проживание в монастыре стало крайне тяжелым. В какой-то момент толпа атаковала монастыри и подожгла постройки. Кто были эти люди? Беженцы-язычники из Италии после победы Алариха? Неизвестно. Некоторое время Иероним и Евстохия вынуждены были скитаться. Но они вернулись в монастырь. Туда же прибыла внучка Павлы, тоже Павла. В 418 году умерла Евстохия. Иероним пережил двух своих самых близких людей. Несмотря на неурядицы, Иероним продолжал трудиться. Последней его работой были комментарии на книгу пророка Иезекииля.
Умер Иероним 30 сентября то ли 419, то ли 420 года. Он был похоронен в Вифлееме. В XIII веке стали утверждать, что его останки перевезены в Рим и находятся где-то в Сикстинской капелле.
Очень долго, вплоть до XV столетия, Иеронима чтили, прежде всего, как аскета. Его считали самым преданным Иисусу человеком. Иероним победил свою плоть и тем самым заслужил вечную славу на небесах. По святости он не уступал Иоанну Крестителю и апостолам. В легендах он оставался девственником до самой смерти, ни разу в жизни не прикоснулся ни к рыбе, ни к мясу, и даже не употреблял слов, означавших скоромную пищу. Иероним носил власяницу, спал на камнях и три раза
