Средневековый роман в стихах «Кун Чон Кун Пэн», рисующий картины жизни времен Рама Тибоди II, сохранил рассказ о наборе в войска для похода на север. Кун Пэн получил приказ (
чакр) от правителя набрать войско для похода на Чиенгмай. Он требует: «Привести людей (прай) силой либо заставить хозяев (най) занять место зависимых от них людей, если последние скрылись. Забирайте деньги вместо службы у тех, кто болен, собирайте слонов и коней, распределяйте пушки и каменные ядра, все необходимое для военных действий». Аналогично набиралось войско и в Чиенгмае: «Должностные лица собирали мужчин или приводили жен и детей тех, кого не могли найти. Дабы принудить людей идти на службу, их били и бранили».
Военные действия Аютии против Чиенгмая, начатые в 1545 г. при правителе Прачае (1534–1546), поддержанные португальскими торговцами, не увенчались успехом. В столице Сиама началась борьба за власть клана (рачакун) жены правителя с правившим кланом. В конечном итоге дворец занял брат Прачая — Маха Чакрапат (1549–1569), последний в династии, правившей в Аютии с 1350 г.
С притязаниями на материальные ресурсы Индокитая, на районы, откуда поступала экспортная продукция, и их захват с помощью военной силы выступило бирманское государство Таунгу. В 1549 г. войска бирманского правителя, перейдя западные горы через перевал Трех Пагод, спустились в долину р. Менам и подошли к Аютии. Судьбу последней решала битва на слонах правителей Бирмы и Сиама. Маха Чакрапата в битве поддерживали его жена Пра Сурийотай, переодетая в мужской костюм упарата, дочь и два его сына. Поединок был неудачен для сиамской стороны: Пра Сурийотай была убита на своем боевом слоне наместником Прома, погибла и дочь. Правитель с войском укрылся за крепостным валом в Аютии. Положение спас наместник Сукотаи, Питсанулока и Кампенгпета, подошедший с войском на выручку Аютии. Бирманское войско отступило и направилось в Кампенгпет, где его настигло войско, набранное в Питсанулоке. Но командовавший им Пра Маха Дхармарача попал в засаду и был взят в плен бирманцами. За выкуп (правителю Таунгу были переданы два прославившихся боевых слона) Дхармарача был освобожден.
Военное столкновение с бирманским государством показало господствующему классу Аютии силу нового соперника. Для укрепления обороноспособности были приняты такие меры, как тщательно проводимый учет мужского населения не только в окрестностях столицы, но и дальше на север — до Чайната и на юг — до Чонбури и Петбури. За набор войск отвечала местная администрация во главе с наместниками. Трудоспособное население было собрано по приказу правителя в Аютии, окружавший ее земляной вал заменила стена из кирпича, был сооружен ров, защищавший столицу с севера. Крепостные валы других укрепленных пунктов (в Супанбури, Лопбури, Накхоннайоке) были срыты, усилен речной флот, построены суда новых образцов. Увеличилось число слонов, обслуживавших транспортные нужды войска. Правители северных и южных государств, сохранявших независимость от Аютии, передали Маха Чакрапату белых слонов — знак вассальной зависимости. В стойлах Аютии оказалось семь белых слонов, символизировавших политическую силу государства.
В 1563 г. правитель Таунгу Байиннаун, в 1556 г. поставивший под свою власть Чиенгмай, потребовал от Аютии в знак признания его политической значимости передать двух белых слонов. Отказ Маха Чакрапата от выдачи белых слонов бирманскому князю послужил сигналом к началу военных действий. Бирманские войска на этот раз шли через Кампенгпет, в их составе было 400 португальских наемников. Наемники-португальцы состояли и в войске Аютии.
Постепенно северные мыанги, где правили наместники Аютии, признали сувереном Байиннауна и повернули войска против Аютии. Войска бирманской коалиции вновь оказались под стенами столицы Сиама.
Байиннаун на правах победителя потребовал уже четырех белых слонов, выплаты дани в размере 30 слонов и 300 катти (около 180 кг) серебра, передачи права на сбор пошлин в западном порту государства — Мергуи. Правитель Аютии Чакрапат согласился на эти требования. Под властью Аютии остались Лигор (Накхонсритхаммарат) на юге и Накхонратчасима — на востоке. Войска Байиннауна отошли от стен Аютии.
Правящая элита Аютии, несмотря на поражение, нашла средства для дальнейшего укрепления обороноспособности столицы. В крепостной стене были пробиты бойницы, а в них помещены пушки разного калибра. Строились новые крепости, также вооруженные пушками; по берегам р. Менам возводились форты. Предпринимались и дипломатические усилия (поиск союзников против Таунгу среди лаосских государств), а также военные действия против Питсанулока, где правил зять Маха Чакрапата, перешедший под сюзеренитет Байиннауна.
Активность Аютии вызвала подозрения в Таунгу. В ноябре 1568 г. бирманские войска были отправлены к стенам Аютии. Столица Сиама активно оборонялась, но ситуацию усложнила смерть правителя Маха Чакрапата. Его преемник, Пра Махин, не сумел удержать под контролем враждующие группы столичной знати. После девяти месяцев обороны Аютия была сдана. Это произошло 30 августа 1569 г. В Бирму были уведены молодые и сильные жители столицы и ее окрестностей, семья правителя и он сам, многие из столичной знати. Туда же была переправлена государственная казна Сиама. Укрепления Аютии были уничтожены, а сама она превращена в «удел». Править в ней стал зять Чакрапата — Пра Маха Дхармарача. Аютия на 15 лет попала в зависимость от бирманского государства. Заложником в Таунгу был направлен сын Дхармарачи принц Наресуан. По красноречивой оценке португальца Мендеша Пинто, падение Аютии было событием первостепенной важности для Азии того периода, ибо это было самое большое государство между Индией и Китаем.
Бирманское завоевание разрушило архаичную государственную систему Аютии, основанную на концентрации религиозной и политической власти, материальных и человеческих ресурсов в одном центре, и тем самым сыграло в какой-то мере позитивную роль, освободив провинции от гнета со стороны центра. Молодое бирманское государство не могло, конечно, удержать все завоеванные территории. Оно предоставляло им широкую автономию. В Аютии правил Маха Дхармарача, выходец из правящей семьи Сукотаи. В 1571 г. в Питсанулок из Таунгу был направлен «кормленщиком» его сын Наресуан, сумевший создать на основе общинных отрядов самообороны конные боевые отряды молодежи, получившие название «дикие тигры».
В условиях децентрализации усилились административные и экономические позиции местной наследственной администрации с титулом кун. Эти социальные силы и возглавили борьбу за восстановление независимости Сиамского государства. Поддержал эту борьбу и торговый капитал в Аютии.
В 1584 г. принц Наресуан (Пра Нарет) в Питсанулоке провозгласил независимость Сиамского государства от Таунгу. Ему удалось собрать и вернуть в Сиам уведенные бирманцами в полон сиамские семьи. С ними в Аютию пришли семьи монов, поселенные Наресуаном в Аютии. На севере, около Питсанулока, были расселены шаны, бежавшие из Бирмы.
В 1590 г., после смерти отца, Наресуан стал правителем в Аютии: сплотив вокруг себя искусных военачальников, он сумел отбить последовавшие атаки бирманского соседа. В 1593 г. под власть Аютии были
